论文题目：尼日尔新型冠状病毒肺炎的流行与控制 ——一项最不发达国家的定量分析
摘要：[研究背景]新型冠状病毒肺炎（COVID-19,下简称新冠肺炎）最初在中国武汉被发现,已迅速蔓延至各大洲。全球各国迅速做出反应,并采取了不同的缓解措施,如限制旅行和出行、禁止集会、全面或部分封城、洗手和卫生促进运动。新冠肺炎大流行不仅是一种公共卫生危机,也是一种经济和社会危机。即使对全世界的发达国家来说,尽管它们拥有相当先进的技术平台,该病也正在向失控的趋势转变,因此,对于卫生系统不稳定的脆弱国家来说更是如此。最初人们担心新冠肺炎全球大流行将对最不发达国家（LDCs）的健康造成灾难性影响,但这一担心并未实现。由于国际航空受限,与世界其他地区相比,该病传播到非洲的时间略晚。鉴于病例数量不断增加和医疗体系的脆弱,非洲可能成为该病的最新流行区。此外,最不发达国家人口稠密的贫民窟和难民营极有可能暴发无法控制的新冠肺炎。新冠肺炎目前正在贫困地区、战乱地区和最不发达国家广为流行,这提示我们应确定因地制宜的应对方法。尼日尔是西非最大的国家,也是最不发达国家之一,经济脆弱,受教育水平低,基础设施缺乏,没有医疗保障。跨境经济活动带来的是输入性病例的高发率。实际上,一些最不发达国家的确诊病例很低可能是由于检测设施的缺乏。尼日尔目前正面临武装袭击和绑架的严重威胁,这无疑加剧了健康危机。2020年3月19日,一名在运输公司工作的36岁的尼日尔仓库管理员近期因出国旅行被确认为尼日尔第一例新冠肺炎病例。此后,新冠肺炎迅速传遍全国。此外,移民人口进一步加速了跨国和跨地区传播。鉴于尼日尔的社会、经济、文化和宗教情况,新冠肺炎在该国的流行情况十分复杂。事实上,尼日尔当局很早就采取了措施,防止病毒向其他地区传播,因为尼日尔除了面临新冠肺炎的健康危机外,还面临着许多挑战。[研究目的]本研究的目的是评估新冠肺炎在尼日尔的流行情况。具体目标如下:1.尼日尔新冠肺炎流行特征调查。2.评估新冠肺炎在尼日尔的传播动态。3.评价新冠肺炎在尼日尔的防治效果。4.尼日尔新冠肺炎的疾病负担估计。5.在尼日尔制定有针对性的新冠肺炎预防和控制措施。6.为最不发达国家提供循证指导,以抗击目前暴发的新冠肺炎。[研究方法]1.研究地区和数据来源:我们的研究框架针对尼日尔人群,更具体地说是任何患有新冠肺炎的尼日尔患者。尼亚美总转诊医院是新冠肺炎诊断患者的转诊中心,以便更好地进行管理,具有先进和现代化的技术平台。此外,尼日尔其他地区的国家级和地区级医院是其他的转诊中心,为那些因资源有限而被限制在家中的新冠肺炎患者和轻度新冠肺炎患者提供转诊服务。巴斯德研究所成员之一的尼日尔医学研究与健康中心（CERMES）是位于首都尼亚美的一所研究中心,在那里进行各种新冠肺炎的确诊检查。此外,全国各地的各种PCR检测也被送往该中心进行诊断确认。2.这是一项描述性研究,时间为2020年3月19日至2020年7月4日,因为尼日尔当局正式授权在该特定时期收集数据。所以我们只能在这个相对较短的时间段内开展本研究。3.我们从尼日尔公共卫生部（MoH）的流行病监测和应对局获得了有关新冠肺炎的数据。人口特征（如年龄、性别、职业、居住地）、流行病学特征（如旅行和接触史、症状出现日期、入院日期、诊断日期、报告日期）和临床特征（如医疗处理、体征和症状、临床结局）。连续变量以中位数（四分位间距,IQR）表示,分类变量以频率（n）或比例（%）表示。组间差异采用卡方检验χ2。根据累计确诊病例数除以人群规模计算发病率（AR）。病死率（CFR）表示为已确认病例中的死亡百分比。4.进行时空分析确定疾病的空间异质性。Kulldorff时空扫描统计分析被用于探索新冠肺炎在尼日尔的时间、空间和时空分布。对数似然比（LLR）主要用于确定第一聚集区和次要聚集区。相对危险度（RR）是评估每个聚类区风险的重要指标,其计算方法是用聚类内的估计危险度除以聚类外的估计危险度。蒙特卡罗模拟次数设为999次,显著性水平设为0.05。5.与防控措施有关的第t天的有效再生数（Rt）。Rt定义为第t天出现症状的一个原发病例所传染的继发病例的平均个数。该指标通过使用Cori等人开发的方法进行估计,置信区间（CI）采用bootstrap计算。主要的防控措施包括设立防控指挥部、一级应急响应、官方的防控计划、定位和公共信息、病例流行病学调查、主动寻找接触者、疑似病例的家庭检疫、旅行建议和检疫、新冠肺炎患者的转诊、新冠肺炎临时管理场所的建设、医院感染控制指南、分诊设施/发热诊所、关闭学校、关闭公共场所、公共场所测温、公共场所须戴口罩等。这些措施随病毒传播动态而采取,以便更好地评估政府采取的措施。6.尼日尔新冠肺炎的疾病负担通过伤残调整寿命年（DALYs）估计,它结合了因过早死亡而丧失的寿命损失年（YLLs）和健康寿命损失年（YLDs）。所有统计分析均采用R软件（版本4.0.2）和SPSS软件（版本21.0）进行。双侧p值小于0.05为具有统计学意义。[研究结果]1.尼日尔的新冠肺炎概况:截至2020年7月4日,尼日尔报告了 1093例确诊病例,中位年龄43岁（IQR=28-57岁）。男性病例约为女性的两倍（67.8%对32.2%）。从症状出现到住院、诊断和报告的时间间隔分别为3天（IQR=1-7天）、5天（IQR=2-9天）和6天（IQR=3-10天）。咳嗽（69.9%）和发热（63.2%）是最常见的症状,其次是呼吸系统症状,如气短（36.9%）、咽痛（23.6%）、流涕（18.2%）和胸痛（9.4%）。全身症状包括头痛（15.7%）、疲劳（9.0%）、嗅觉丧失（7.8%）和不适（2.2%）。少数病例出现胃肠道症状,包括腹泻（2.7%）和厌食（2.2%）。在1093例确诊病例中,89例死亡,病死率为8.1%,医护人员占15%。报告病例中,39.3%在家中隔离治疗,42.3%无症状。74.6%的病例集中在尼日尔首都尼亚美。2.尼日尔新冠肺炎的空间分布:研究期间,新冠肺炎影响了尼日尔全部8个地区（7个地区和首都区）的29个社区。虽然规模较小,但尼亚美报告了近四分之三的确诊病例,总AR=1078.3/100万。ARs＞100.0/100万的社区聚集于尼亚美一世（3449.6/100万）、尼亚美五世（204.4/100万）、阿利特（438.0/100万）、津德尔四世（343.7/100万）。大约一半的社区ARs＜15.0/100万。根据空间聚类分析,最可能的空间聚类区域位于尼亚美Ⅰ和尼亚美Ⅲ社区（LLR=1512.5,RR=36.7,P＜0.0001）,第二聚集区是津德尔社区（LLR=46.1,RR=3.0,P＜0.0001）。3.尼日尔新冠肺炎的时间分布:尼日尔疫情始于2020年2月25日,在4月2日左右达到高峰。大多数病例是在2020年4月6日至11日期间诊断和报告的。在首个病例确诊前,尼日尔于2020年3月17日就采取了限制社交的法令,包括关闭学校和禁止公共集会。当COVID-19在尼日尔出现的最初时期,其Rt在0.4和3.0之间波动,且95%置信区间较宽。3月19日,尼日尔当局制定了《国家COVID-19突发事件应急预案》,以有效应对疫情。然而,由于病毒在尼亚美地区和其他地区的迅速传播,Rt值急剧上升至峰值6.7。随后,在3月20日实施了一系列有针对性的控制措施后（如关闭礼拜场所、健康筛检、出入境管制、禁止非必要探访羁押中心、建立临时医院和居家隔离）,Rt值明显降低。一周后,尼日尔宣布国家卫生紧急状态,并开始在尼亚美实行旅行禁令和宵禁。考虑到高输入率和疾病扩散风险,尼亚美于3月29日宣布封城。此后,Rt在一周内（4月7 日）维持在1以下。从那以后,即使尼日尔在5月13日重新开放礼拜场所,Rt也在1左右略有波动。4.尼日尔新冠肺炎的疾病负担:研究期间,新冠肺炎导致的尼日尔总伤残调整寿命年为1267.38年,0.05年/1000人。疾病负担主要来自45岁以上人群（占总伤残调整寿命年的82.59%）。80岁以上人口每1000人的伤残调整寿命年最高（1.45年/1000人）。总的来说,死亡率占疾病负担的主要部分,寿命损失年占伤残调整寿命年的99.1%以上。疾病负担主要来自45岁以上人群（占总伤残调整寿命年的82.59%）,男性疾病负担高于女性（832.96 vs 434.42）。男、女性中,45-59岁年龄组的伤残调整寿命年最高（259.92 vs 121.11）,而5-14岁的男孩（0.24）和0-4岁的女孩（0.00）最低。80岁以上人口每千人伤残调寿命年最高,男性为1.78,女性为1.21。此外,关于健康寿命损失年（YLDs）,45-59岁男性最高,为2.19;30-44岁女性最高,为1.24。[研究结论]1.国家应对和公共卫生防控措施在限制流行区域,减缓传播方面效果明显。为了防止病例数量的增加和大量病人涌入医院,政府采取了限制人口流动的缓解措施,从而中断了传染链。2.在防控新冠肺炎过程中,尼日尔当局参与有效决策和多部门合作,并在流行病管理方面采取多学科合作的办法,这为其他最不发达国家树立了榜样。3.绝大部分的疾病负担归因于早死,YLLs占DALYs的99%以上。这表明通过改善尼日尔医疗服务的可及性和质量来降低新冠肺炎死亡率的重要性。
关键词：新冠肺炎;最不发达国家;尼日尔;流行病
学科专业：流行病与卫生统计学
中文摘要
英文摘要
Abbreviations
1.Introduction
1.1 Background
1.1.1 Origin and classification of COVID-19
1.1.2 Transmission of COVID-19
1.1.3 Symptoms of COVID-19
1.1.4 Diagnosis of COVD)-19
1.1.5 Epidemiology of COVID-19
1.2 Objectives
2.Materials and Methods
2.1 Research Area
2.2 Research Period
2.3 Data collection
2.4 Case Definition
2.5 Methods
3.Result
3.1 General situation of COVTD-19 in Niger
3.2 Spatial distribution of COVID-19 in Niger
3.3 Population distribution of COVID-19 in Niger
3.4 Temporal distribution of COVID-19 in Niger
3.5 Disease Burden of COVID-19 in Niger
4.Discussion
4-1 General Situation of COVID-19 in Niger
4-2 Dynamic transmission of COVID-19 in Niger
4-3 Public Health measures evaluation
4-4 Disease burden
4-5 Strengths and limitations
5. Conclusion
References
Acknowledgements
Publications